78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0991 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  46.06 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  39.33 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  37.62 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  35.56 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  34.07 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  37.93 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  33.95 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  33.85 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  53.15 
 
 		 120 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.21 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32.17 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  32.01 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  30.19 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  29.93 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  34.06 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  35.19 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  28.29 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.55 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  33.47 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  28.65 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  35.91 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  32.64 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.26 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  26.97 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  33.9 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  35.75 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  35.75 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  35.75 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.56 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  28.28 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  32.35 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  33.79 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  33.79 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  29.43 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  24.34 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  27.63 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  33.79 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.1 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.67 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.67 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  28.75 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  28.99 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  30.37 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.76 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  29.82 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  26.71 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  37.59 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  29.3 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  30.5 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  36.72 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.52 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.12 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  35.63 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.12 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  28.15 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  27.71 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4266  hypothetical protein  36.19 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  29.19 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  30.99 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  27.14 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.23 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  32.28 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  29.1 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  29.1 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>