43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0324 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0324  Molecular chaperone-like protein  100 
 
 
350 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0308  hypothetical protein  29.35 
 
 
598 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  27.34 
 
 
957 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4728  molecular chaperone DnaK  25.34 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0431  hypothetical protein  26.64 
 
 
601 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0621  hypothetical protein  27.8 
 
 
610 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0454  hypothetical protein  26.64 
 
 
601 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23785  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0444  hypothetical protein  26.64 
 
 
601 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2183  chaperone protein DnaK  25.17 
 
 
640 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4727  molecular chaperone DnaK  24.73 
 
 
641 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4593  molecular chaperone DnaK  24.73 
 
 
611 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0705  molecular chaperone DnaK  24.73 
 
 
642 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.991542  hitchhiker  0.00373159 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0521  chaperone transmembrane protein  26.19 
 
 
593 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362159  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0763  molecular chaperone DnaK  24 
 
 
638 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.240702  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36840  hypothetical protein  23.75 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5481  molecular chaperone DnaK  25.36 
 
 
637 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62970  molecular chaperone DnaK  25.36 
 
 
637 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0423823  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
637 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0433  hypothetical protein  27.18 
 
 
582 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1780  chaperone protein HscA  27.1 
 
 
620 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0558  molecular chaperone-like protein  26.95 
 
 
439 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  24.64 
 
 
638 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  23.67 
 
 
641 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28169  Heat Shock Protein 70, cytosolic  24.19 
 
 
650 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158488  hitchhiker  0.00292579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  23.91 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1472  chaperone protein DnaK  23.93 
 
 
634 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0182845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  25 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01185  molecular chaperone DnaK  23.05 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0550021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  27.64 
 
 
759 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2371  molecular chaperone DnaK  22.34 
 
 
641 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0498506  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0917  chaperone protein DnaK  22.26 
 
 
640 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.426947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2145  chaperone protein HscA  26.79 
 
 
620 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000851094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  23.4 
 
 
638 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4294  chaperone protein HscC  24.61 
 
 
564 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2728  chaperone protein HscA  27.82 
 
 
622 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1484  molecular chaperone DnaK  23.51 
 
 
640 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.840075  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  27.82 
 
 
622 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  27.82 
 
 
622 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  24.2 
 
 
644 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0972  molecular chaperone DnaK  23.64 
 
 
641 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  24.2 
 
 
644 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4769  heat shock protein Hsp70  23.99 
 
 
565 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42970  molecular chaperone DnaK  24 
 
 
642 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>