179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3612 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  57.74 
 
 		 253 aa  254  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  48.03 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.68 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  31.78 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.65 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.22 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.63 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30.25 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  25.09 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.38 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.63 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  32.32 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.56 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  31.84 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.35 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  30.94 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  33.76 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  27.71 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.79 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.05 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.35 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  34.38 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.55 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  27.94 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  26.09 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  34.36 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3354  hypothetical protein  28.34 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  32 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.99 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.88 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27.61 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.67 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.93 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  27.68 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.28 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.09 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  26.44 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27.23 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.47 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  28.22 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  26.54 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  32.45 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  27.38 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  33.79 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.71 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  31.76 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  32.28 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  26.4 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  29.01 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0128  phosphate binding protein  31.58 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  25.27 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  31.29 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  28.79 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.59 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  26.41 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  33.1 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.44 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.31 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  27.23 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13780  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.76 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0228402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  27.71 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  27.1 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 585 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  24.29 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  27.1 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  29.49 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  27.1 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  27.95 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  31.33 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  27.71 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4766  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate- binding protein  28.74 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.54 
 
 		 293 aa  62  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  31.93 
 
 		 307 aa  62  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  36.07 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  30.34 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  27.01 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  32.56 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  27.19 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6248  putative phosphate binding ABC transporter  32.79 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0983725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25.81 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  26.95 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  36.19 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.78 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  24.54 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  28.31 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  31.21 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 		 435 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.57 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  24.87 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>