More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2835 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  96.68 
 
 		 391 aa  773    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  81.59 
 
 		 391 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  72.12 
 
 		 391 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  71.1 
 
 		 391 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  69.31 
 
 		 391 aa  554  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 		 391 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  52.85 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  51.54 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  52.84 
 
 		 416 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  51.04 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  52.33 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  50.64 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  51.8 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  49.23 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.94 
 
 		 393 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  51.8 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  51.03 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  51.93 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  51.55 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  51.8 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  52.2 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  50.9 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.64 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.03 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.04 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  54.24 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0098  thiolase  51.27 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  49.74 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>