More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2288 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  97.45 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  63.81 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  60.97 
 
 		 275 aa  314  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  57.66 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  56.51 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  53.38 
 
 		 271 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  41.42 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  46.51 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  44.49 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  37.92 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.53 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.42 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  39.78 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  37.55 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  42.96 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  42.07 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  42.07 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  36.78 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  38.2 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  37.37 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3685  dimethyladenosine transferase  40.96 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.401962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.26 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  41.15 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 		 296 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.26 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  37.64 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6886  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.21 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  37.83 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  39.1 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  39.53 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  37.97 
 
 		 263 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>