159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3234 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  71.32 
 
 
142 aa  203  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  41.96 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  38.21 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  38.39 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  41.58 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  38.24 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  38.74 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  32.52 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  34.15 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  35 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  33.6 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  35.29 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  32 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  34.92 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  33.63 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  33.65 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  33.65 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  34.55 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  33.02 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  32.99 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  26.72 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  36.19 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  34.69 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  33 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  28.7 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  34.02 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  31.93 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  35 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
275 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  29.7 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
286 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  31.82 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  32.43 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  29.03 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  31.43 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  33.64 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  32.35 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  30.69 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  33.94 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
137 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  30.61 
 
 
136 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  30.36 
 
 
133 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  30.61 
 
 
136 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  31.68 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  27.78 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  28.24 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  28.24 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  28.97 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  28.04 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  30.36 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  27.83 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  28.97 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  31.58 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  33.03 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  29.09 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>