More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3084 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  85.83 
 
 		 127 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  68.25 
 
 		 127 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  67.46 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  67.46 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  67.2 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  61.9 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  60.63 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  56.9 
 
 		 134 aa  136  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  58.72 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  52.27 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  51.18 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>