More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1458 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 461 aa  922    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  37.67 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  36.92 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 473 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  37.34 
 
 		 474 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  36.5 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  36.94 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  36.75 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  36.9 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  36.75 
 
 		 478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  36.9 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  37.69 
 
 		 487 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  36.9 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  33.33 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  33.33 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  36.73 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  38.33 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  36.68 
 
 		 473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  36.48 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  39.35 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  36.68 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  40.22 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  33.26 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  40.72 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  36.32 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  34.89 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  39.19 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  39.19 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  35.11 
 
 		 472 aa  310  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  36.46 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  37.8 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  37.79 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  37.79 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  38.26 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  38.5 
 
 		 473 aa  309  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  38.5 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  38.12 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  36.32 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  39.15 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  35.11 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  36.32 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  37.56 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  34.51 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.78 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  34.51 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  34.5 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  37.32 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  34.51 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  36.66 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  39.16 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0458  amino acid permease-associated region  35.84 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  38.88 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  32.59 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.07 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.07 
 
 		 463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.07 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.07 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.07 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  34.99 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  38.33 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  38.33 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  38.33 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  38.33 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  36.17 
 
 		 459 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 469 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.63 
 
 		 473 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.56 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  37.44 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  36.18 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 463 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  35.53 
 
 		 467 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.38 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 467 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4001  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 467 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070597  hitchhiker  0.0000638701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  38.8 
 
 		 472 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.08 
 
 		 468 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.08 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.13 
 
 		 467 aa  299  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  37.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  37.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  37.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>