22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2586 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1198    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  38.55 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  44.76 
 
 		 940 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  34.73 
 
 		 1081 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.16 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  33.33 
 
 		 845 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  35.71 
 
 		 998 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1027 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  34.32 
 
 		 841 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.42 
 
 		 1323 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  30.41 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.58 
 
 		 2002 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.53 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  33.12 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  25.67 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  37.5 
 
 		 1004 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  28.67 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.23 
 
 		 2117 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  33.77 
 
 		 792 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.57 
 
 		 1095 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  37.93 
 
 		 826 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  27.27 
 
 		 720 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>