More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1378 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  81.07 
 
 		 391 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  790    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  96.68 
 
 		 391 aa  773    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  70.84 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  70.33 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  69.05 
 
 		 391 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  67.77 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  67.52 
 
 		 391 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  50.78 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  51.8 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  51.3 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  51.41 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  50.51 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  48.71 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  50.52 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  51.29 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.92 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.78 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  51.03 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  51.03 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.13 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.9 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0098  thiolase  50.25 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  53.73 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  48.97 
 
 		 391 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 392 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>