56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1022 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.93 
 
 		 239 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  70.04 
 
 		 241 aa  336  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.88 
 
 		 243 aa  331  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3439  hypothetical protein  79.19 
 
 		 202 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.91 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.89 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  29.82 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.15 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  22.69 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  22.69 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  25.81 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  22.69 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.22 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.22 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.22 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  24.4 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  26.88 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  24.12 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  31.94 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  24.12 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  31.94 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  31.94 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  28.05 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  26.55 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.03 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  36.11 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  44.23 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  35.71 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.63 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  35.71 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  35.14 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  34.15 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  32.98 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>