72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6498 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  88.04 
 
 		 184 aa  336  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  40.62 
 
 		 210 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  38.51 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  36.7 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  33.53 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1672  protein of unknown function DUF820  31.66 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  35.14 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  33.69 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  37.14 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  29.56 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  34.29 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  32.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  32.03 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.12 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35.43 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  30.15 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  31.54 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  33.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  31.06 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  29.86 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  29.17 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.01 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  35.76 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  29.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  31.39 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  26.38 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  26.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  28.33 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  25.37 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  31.9 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  28.08 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  25.54 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  28.32 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  29.88 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  29.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  36.44 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  29.12 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  28.68 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  30.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  24.84 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  28.37 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 		 203 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 		 239 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 254 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  26.5 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  25.67 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  30.16 
 
 		 233 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  23.85 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  28.33 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0558608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>