More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5883 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
314 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  85.02 
 
 
364 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  69.76 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1368  glycosyl transferase, family 2  67.32 
 
 
309 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  68.58 
 
 
298 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4093  glycosyl transferase family 2  68.6 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  65.15 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  61.86 
 
 
305 aa  387  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  62.8 
 
 
327 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  61.82 
 
 
306 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3775  glycosyl transferase family 2  62.71 
 
 
311 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0748146  normal  0.865798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
336 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
295 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
299 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.99 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
311 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
311 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
343 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
291 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
312 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
317 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
298 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
314 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.07 
 
 
327 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
411 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
394 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
304 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
414 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.13 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
420 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.01 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
358 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.48 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.69 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  28.48 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.48 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
366 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.48 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  28.48 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  25.48 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
325 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.48 
 
 
322 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.16 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
480 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.37 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
341 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  23.82 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  25.08 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.28 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
315 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  24.92 
 
 
330 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  27 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.44 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
430 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
230 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  25.96 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  26.28 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  25.96 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>