35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5828 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5828  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0777  hypothetical protein  75.61 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  44.12 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1731  hypothetical protein  46.15 
 
 		 163 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  47.69 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0895  putative NADH dehydrogenase I chain E  43.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  32.11 
 
 		 402 aa  57  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  47.69 
 
 		 222 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  42.03 
 
 		 214 aa  54.3  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1723  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1789  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  40.3 
 
 		 226 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1117  NADH dehydrogenase I chain E  42.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160144  normal  0.345455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.55 
 
 		 221 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  45.76 
 
 		 395 aa  50.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1114  ABC transporter related  40.45 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0650865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3103  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2782  hypothetical protein  42.19 
 
 		 193 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.742585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1197  hypothetical protein  43.55 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  38.71 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38.46 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1177  hypothetical protein  41.94 
 
 		 250 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0930686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3827  hypothetical protein  40.62 
 
 		 253 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.290909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3150  hypothetical protein  37.66 
 
 		 167 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  42.19 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 243 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 		 388 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2652  hypothetical protein  41.94 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.06 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.33 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  36.62 
 
 		 398 aa  43.9  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.33 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.320932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>