150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5412 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5412  transposase  100 
 
 		 170 aa  348  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0306805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  78.57 
 
 		 394 aa  276  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  78.57 
 
 		 418 aa  276  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  39.35 
 
 		 403 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  45.24 
 
 		 445 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  40 
 
 		 462 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  40 
 
 		 462 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  40 
 
 		 462 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  40 
 
 		 462 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  39.13 
 
 		 399 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  39.13 
 
 		 399 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  36.65 
 
 		 396 aa  90.9  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  37.58 
 
 		 390 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  39.49 
 
 		 432 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  35.82 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  33.82 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  33.82 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  33.82 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  33.82 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  33.82 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  43.52 
 
 		 427 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  35.56 
 
 		 401 aa  74.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  35.25 
 
 		 417 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  42.65 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  32.79 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3158  transposase  30.83 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3201  transposase  30.83 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5026  transposase-like protein  31.88 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0403517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  35.14 
 
 		 444 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  41.18 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  41.18 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  40.68 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  30.15 
 
 		 439 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  39.71 
 
 		 435 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  29.6 
 
 		 451 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  39.71 
 
 		 298 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  35.21 
 
 		 428 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  39.71 
 
 		 432 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  39.71 
 
 		 463 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  39.71 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  39.71 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  39.71 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  29.6 
 
 		 458 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  29.6 
 
 		 451 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  29.6 
 
 		 451 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1508  hypothetical protein  43.4 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 443 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 443 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 453 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 453 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 453 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 453 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  38.36 
 
 		 445 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04445  trancated ISXo8 transposase  36 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  26.88 
 
 		 483 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04846  ISXo8 transposase  36.99 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  26.88 
 
 		 426 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  53.66 
 
 		 46 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 		 430 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  26.88 
 
 		 351 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01472  trancated ISXo8 transposase  36.71 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01539  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0768502  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02584  trancated ISXo8 transposase  36 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  26.88 
 
 		 483 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  39.13 
 
 		 469 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06089  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 483 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  26.97 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 328 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05626  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.122564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  26.97 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03295  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 467 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 467 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  26.97 
 
 		 501 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 469 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  29.33 
 
 		 396 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00051  trancated ISXo8 transposase  35.62 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 460 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00268  ISXo8 transposase  26.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02644  trancated ISXo8 transposase  35.62 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  26.97 
 
 		 382 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>