149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3175 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  100 
 
 
46 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  82.61 
 
 
432 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  82.61 
 
 
435 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  80.43 
 
 
418 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  80.43 
 
 
390 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  80.43 
 
 
432 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  67.39 
 
 
412 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  67.39 
 
 
412 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  67.39 
 
 
412 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  70.45 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  62.22 
 
 
428 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
800 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
443 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
445 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
443 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
453 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
453 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
453 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
453 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2203  ISRSO17-transposase protein  61.54 
 
 
469 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
439 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
544 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0153  putative transposase  61.54 
 
 
427 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  61.54 
 
 
430 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00268  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03295  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
197 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  58.97 
 
 
478 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05576  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
426 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
467 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06089  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41850  transposase  58.97 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05626  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.122564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00051  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00316  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
351 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.570506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00332  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
432 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00371  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01472  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01503  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
328 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  58.97 
 
 
453 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01754  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01989  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
338 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02155  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
328 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
403 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02584  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02644  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  58.97 
 
 
453 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
412 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
403 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03791  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
501 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04445  trancated ISXo8 transposase  63.16 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
747 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  56.1 
 
 
463 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
550 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
467 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
467 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
483 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
483 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01864  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
453 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
483 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
382 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
473 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
473 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
469 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04602  ISXo8 transposase  63.16 
 
 
460 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>