167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2904 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2904  transposase  100 
 
 		 389 aa  768    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  95.27 
 
 		 390 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  60.44 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  60.44 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  51.84 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  51.52 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  51.52 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  51.52 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  51.52 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  48.33 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  50.57 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  44.85 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  46.38 
 
 		 432 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  45.26 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  44.89 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  45.05 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  45.97 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  66.44 
 
 		 165 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  44.53 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  44.53 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  44.53 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  44.53 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  44.53 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  40.44 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  57.89 
 
 		 225 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  41.1 
 
 		 317 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  36.1 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  38.17 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  32.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  35.62 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  35.62 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  37.91 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0289  putative transposase  30.19 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  33.49 
 
 		 747 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  37.93 
 
 		 319 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  33.49 
 
 		 747 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  33.04 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  33.04 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06248  ISXo8 transposase  32.44 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0177744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01070  ISXo8 transposase  32.44 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02542  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 495 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  33.03 
 
 		 800 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04444  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00369  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 286 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  32.14 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  33.33 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  33.33 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  33.33 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02315  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  32.14 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 501 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  33.33 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  32.14 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06262  ISXo8 transposase  33.03 
 
 		 269 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01108  ISXo8 transposase  33.03 
 
 		 269 aa  106  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  33.03 
 
 		 460 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  32.57 
 
 		 313 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  32.59 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05574  ISXo8 transposase  33.49 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>