106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2666 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2666  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  277  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  78.03 
 
 		 250 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  74.24 
 
 		 341 aa  209  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  44.83 
 
 		 197 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  33.05 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  32.74 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  32.74 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  32.74 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  45.45 
 
 		 356 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  34.65 
 
 		 363 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  37.35 
 
 		 363 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  31.86 
 
 		 363 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  29.2 
 
 		 360 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  38.67 
 
 		 375 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  31.86 
 
 		 363 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  29.79 
 
 		 356 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  32.29 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  34.78 
 
 		 351 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  29.2 
 
 		 346 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 353 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  28.85 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 353 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 353 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  33.33 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  27.88 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  27.88 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  29.9 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  29.9 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  34.09 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  27.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  31.82 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  37.33 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  37.33 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  37.33 
 
 		 363 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  32.08 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  33.33 
 
 		 363 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  34.48 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  30.99 
 
 		 353 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  27.66 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  27.66 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  27.66 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  27.66 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  27.66 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  25.81 
 
 		 362 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  25.81 
 
 		 362 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  34.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  31.43 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  30.99 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  29.63 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  30.53 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  24.8 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  29.25 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  29.25 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  29.25 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  29.25 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  42.59 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  29.51 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>