188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2309 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  69.92 
 
 
453 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1061    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  39.62 
 
 
236 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  42.86 
 
 
304 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  43.37 
 
 
301 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  43 
 
 
220 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  40.8 
 
 
222 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  40 
 
 
449 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  38.25 
 
 
232 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  37.09 
 
 
243 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  36.8 
 
 
256 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  38.81 
 
 
222 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  43.2 
 
 
412 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  38.66 
 
 
219 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  38.32 
 
 
239 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  36.97 
 
 
225 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  39.29 
 
 
427 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  36.89 
 
 
223 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  38.36 
 
 
327 aa  127  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  45.32 
 
 
404 aa  126  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  38.61 
 
 
221 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  36.87 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  36.92 
 
 
225 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  34.58 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  36.68 
 
 
229 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  33.17 
 
 
231 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  35.05 
 
 
225 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  34.76 
 
 
431 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  36.84 
 
 
218 aa  107  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  34.3 
 
 
218 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  32.28 
 
 
192 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  35.26 
 
 
191 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  35.79 
 
 
192 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  31.25 
 
 
194 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  34.64 
 
 
196 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  34.64 
 
 
196 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  31.25 
 
 
196 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  34.64 
 
 
194 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  34.67 
 
 
202 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  31.25 
 
 
194 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  34.21 
 
 
192 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  34.64 
 
 
194 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  34.64 
 
 
194 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  33.99 
 
 
194 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  29.29 
 
 
428 aa  87.8  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  32.98 
 
 
192 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  32.98 
 
 
192 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  33.99 
 
 
194 aa  87  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  32.8 
 
 
191 aa  87  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  34.74 
 
 
192 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  34.21 
 
 
192 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  33.68 
 
 
192 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  29.13 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  31.41 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  31.41 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  29.13 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  32.83 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  32.68 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  36 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  38.41 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  34.42 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  31.21 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  33.68 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  33.16 
 
 
192 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  32.8 
 
 
192 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  33.16 
 
 
192 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  33.16 
 
 
192 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  34.1 
 
 
191 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  32.8 
 
 
192 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  32.95 
 
 
222 aa  82.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  29.53 
 
 
186 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  34.67 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  33.33 
 
 
191 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  30.73 
 
 
191 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  34.3 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  27.84 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  29.9 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  31.41 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  32.67 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  34.3 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  32.03 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  32.67 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  34 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  31.5 
 
 
227 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  30.69 
 
 
191 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  31.11 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  34 
 
 
191 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  33.52 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  31.37 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  31.11 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  30.69 
 
 
190 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  31.33 
 
 
192 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  31.11 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  30.73 
 
 
191 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  30.73 
 
 
191 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  31.63 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>