More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0353 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
383 aa  737    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4264  phosphate ABC transporter permease  72.85 
 
 
347 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  65.68 
 
 
325 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  65.54 
 
 
326 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.54 
 
 
328 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60 
 
 
694 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  55.63 
 
 
320 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.5 
 
 
369 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.31 
 
 
320 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  54.26 
 
 
327 aa  305  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.92 
 
 
325 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.29 
 
 
318 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0092  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.89 
 
 
332 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.902581  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  52.98 
 
 
314 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.67 
 
 
310 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.33 
 
 
310 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.06 
 
 
352 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.61 
 
 
348 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.72 
 
 
353 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.15 
 
 
336 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.34 
 
 
344 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  45.45 
 
 
326 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.48 
 
 
312 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0874  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.75 
 
 
328 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.51 
 
 
319 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2967  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.35 
 
 
330 aa  255  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2963  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.54 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.99 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1071  phosphate ABC transporter permease  47.32 
 
 
317 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.91 
 
 
349 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  44.91 
 
 
349 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.91 
 
 
349 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0457  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.71 
 
 
373 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.98 
 
 
334 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  44.97 
 
 
320 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10947  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstC2  46.08 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.93 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.334683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0915  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.02 
 
 
335 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.93 
 
 
336 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5091  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.4 
 
 
322 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  44.58 
 
 
324 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.61 
 
 
336 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.61 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.61 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.35 
 
 
334 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.99 
 
 
328 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.75 
 
 
322 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.75 
 
 
322 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0636  phosphate ABC transporter permease  41.18 
 
 
332 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284804  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.16 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  41.16 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  40.62 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  40.62 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  40.62 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  42.02 
 
 
319 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
329 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.58 
 
 
325 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.3 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  37.71 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  37.71 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  37.71 
 
 
315 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  40.19 
 
 
315 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.19 
 
 
324 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  40.06 
 
 
318 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  40.55 
 
 
307 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1987  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  41.84 
 
 
332 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08651  putative phosphate ABC transporter  39.67 
 
 
326 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.697879  hitchhiker  0.00114126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.87 
 
 
341 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  40.45 
 
 
328 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.67 
 
 
354 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  40.44 
 
 
337 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  36.7 
 
 
315 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  39.63 
 
 
342 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  39.81 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  38.92 
 
 
328 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  41.47 
 
 
316 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  38.92 
 
 
328 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  38.92 
 
 
328 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  42.19 
 
 
315 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  39.3 
 
 
324 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  42.48 
 
 
316 aa  192  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.78 
 
 
325 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.78 
 
 
317 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  40.84 
 
 
321 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  42.81 
 
 
325 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  38.29 
 
 
328 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  39.31 
 
 
328 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  39.31 
 
 
328 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  42.11 
 
 
316 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  38.2 
 
 
319 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  39.31 
 
 
328 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>