More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
327 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  75.23 
 
 
325 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  77.58 
 
 
353 aa  481  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  73.21 
 
 
336 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2963  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  64.24 
 
 
331 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.75 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  59.43 
 
 
320 aa  348  6e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.22 
 
 
310 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  58.75 
 
 
314 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.22 
 
 
310 aa  341  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2967  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  65.23 
 
 
330 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  54.32 
 
 
319 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1071  phosphate ABC transporter permease  56.51 
 
 
317 aa  324  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.52 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  57.23 
 
 
326 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  55.62 
 
 
326 aa  315  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  52.32 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.59 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.26 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.17 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  55.81 
 
 
320 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.34 
 
 
312 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4264  phosphate ABC transporter permease  52.4 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.69 
 
 
694 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45 
 
 
369 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0092  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.76 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.902581  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.07 
 
 
344 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.93 
 
 
352 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.6 
 
 
349 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  47.6 
 
 
349 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.6 
 
 
349 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10947  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstC2  48.16 
 
 
324 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.59 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.334683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.48 
 
 
348 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.09 
 
 
335 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.57 
 
 
339 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0874  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.18 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.64 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.59 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.99 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5091  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.91 
 
 
322 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359495  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.43 
 
 
324 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.43 
 
 
324 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0915  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.91 
 
 
335 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0457  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.95 
 
 
373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  40.88 
 
 
324 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.15 
 
 
325 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  39.12 
 
 
342 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  41.25 
 
 
319 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.27 
 
 
322 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.27 
 
 
322 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  39.49 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.31 
 
 
325 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  42.95 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  41.43 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  42.95 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  42.95 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  42.95 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  42.63 
 
 
319 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  42.95 
 
 
319 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.27 
 
 
328 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  39.7 
 
 
324 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.6 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.79 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.12 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  39.26 
 
 
324 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  39.82 
 
 
328 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  39.82 
 
 
328 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  39.82 
 
 
328 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.26 
 
 
324 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.17 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  38.61 
 
 
316 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  40.97 
 
 
325 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  40.19 
 
 
315 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.88 
 
 
324 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.03 
 
 
328 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  44.52 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  40.24 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  40.24 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  40.24 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  39.82 
 
 
354 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  40.12 
 
 
328 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  39.04 
 
 
321 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  42.23 
 
 
315 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  41.42 
 
 
328 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.69 
 
 
325 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  41.1 
 
 
328 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  46.53 
 
 
318 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  41.63 
 
 
329 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.46 
 
 
322 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.51 
 
 
317 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.37 
 
 
341 aa  176  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>