More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4262 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4649  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.36 
 
 
318 aa  332  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0363  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.28 
 
 
310 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0203  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.95 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01620  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  54.82 
 
 
319 aa  315  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37630  phosphate ABC transporter membrane protein  53.4 
 
 
314 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.07 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31860  phosphate ABC transporter membrane protein  52.34 
 
 
327 aa  295  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2741  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  52.02 
 
 
320 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0392833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3425  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.05 
 
 
325 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0659  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.56 
 
 
336 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.825746  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06950  phosphate ABC transporter membrane protein  53.02 
 
 
326 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0222  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  50 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  51.31 
 
 
320 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1071  phosphate ABC transporter permease  50.66 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.94 
 
 
694 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2081  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.74 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.601728  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.04 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2963  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.4 
 
 
331 aa  266  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2967  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.04 
 
 
330 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.52 
 
 
325 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.48 
 
 
383 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  50.17 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.05 
 
 
369 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3925  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.46 
 
 
344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4264  phosphate ABC transporter permease  45.4 
 
 
347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6820  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.8 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0092  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.46 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.902581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4518  phosphate ABC transporter permease  43.14 
 
 
349 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4901  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
349 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
349 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.47 
 
 
322 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.334683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0874  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.31 
 
 
328 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3542  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0915  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.51 
 
 
335 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10947  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstC2  41.01 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5091  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
322 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.359495  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5388  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.68 
 
 
335 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0457  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.69 
 
 
373 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  39.3 
 
 
316 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  39.87 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.26 
 
 
324 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.26 
 
 
324 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.18 
 
 
339 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.51 
 
 
325 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  39.48 
 
 
315 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.7 
 
 
322 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.7 
 
 
322 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.39 
 
 
336 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.71 
 
 
336 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.22 
 
 
329 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.58 
 
 
325 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  38.82 
 
 
324 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  36.81 
 
 
328 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.61 
 
 
334 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  42.08 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  36.81 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.55 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.83 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.08 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  37.74 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  37.74 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  37.74 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  38.02 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  41.96 
 
 
342 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  36.31 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  36.31 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  36.31 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  36.31 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  36.31 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.27 
 
 
317 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  37.06 
 
 
328 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  35.69 
 
 
332 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  35.99 
 
 
319 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  36.74 
 
 
312 aa  169  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  36.74 
 
 
312 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  36.54 
 
 
328 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  36.54 
 
 
328 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  36.54 
 
 
328 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  37.5 
 
 
324 aa  169  8e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
324 aa  169  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  36.54 
 
 
328 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  36.28 
 
 
321 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  36.42 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.09 
 
 
315 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.11 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.08 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  36.39 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  36.39 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  36.39 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  35.76 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.88 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>