More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4540 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 		 333 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  87.02 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  64.22 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  60.79 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  61.16 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  62.02 
 
 		 321 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  60 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  66.67 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  68.77 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  56.1 
 
 		 392 aa  348  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  59.21 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  67.29 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  65.2 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  56 
 
 		 391 aa  332  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  64.84 
 
 		 529 aa  331  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  50.95 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  56.51 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  64.6 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  54.08 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  65.06 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  56.76 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  56.76 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  56.76 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  57.49 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  54.84 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  55.49 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  50.14 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  64.53 
 
 		 377 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  64.71 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  62.69 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  50.56 
 
 		 358 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  48.11 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  60.71 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  57.25 
 
 		 268 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  48.14 
 
 		 424 aa  264  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  59.41 
 
 		 624 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  61.19 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  49.45 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  45.22 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  43.8 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.64 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  43.59 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  41.7 
 
 		 283 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  41.7 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.47 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  41.31 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  35.6 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  35.6 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.08 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  41.31 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  36.78 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  40.06 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  43.77 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  42.08 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.93 
 
 		 283 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  43.08 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  44.53 
 
 		 297 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  41.11 
 
 		 256 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  41.31 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.2 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  44.37 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  42.6 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  37.61 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  40.71 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  47.62 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  35.74 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  43.31 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  36.73 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.61 
 
 		 284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  42.58 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  38.43 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  38.04 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  42.59 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  41.7 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.05 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  45.35 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.34 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.15 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  41.8 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.2 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.39 
 
 		 286 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  37.73 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.3 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  40.94 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  45.95 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  45.95 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  41.73 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  38.01 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46.18 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  41.48 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  36.67 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  38.37 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.5 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>