More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4268 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4268  uridylate kinase  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0793924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1808  uridylate kinase  56.54 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3532  uridylate kinase  56.54 
 
 		 247 aa  294  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1663  uridylate kinase  56.12 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1919  uridylate kinase  55.7 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1845  uridylate kinase  56.12 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0560073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1870  uridylate kinase  55.27 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1665  uridylate kinase  56.12 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1797  uridylate kinase  56.12 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1647  uridylate kinase  55.7 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1612  uridylate kinase  55.7 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6119  uridylate kinase  55.33 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.837699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  50 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  48.73 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  47.92 
 
 		 243 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  47.92 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  47.08 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  48.32 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  46.15 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  48.73 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  47.08 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  46.41 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  45.76 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  45.53 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  45.15 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  48.51 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  44.17 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  43.75 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  48.52 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  45.19 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  47.08 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  44.21 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  46.58 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  45.76 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  46.47 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  43.88 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  46.58 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  46.15 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  43.4 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  44.21 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  47.03 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  48.58 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  47.26 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  48.5 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  45.92 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  45.53 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  43.64 
 
 		 235 aa  208  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  46.34 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  48.18 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  46.19 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  42.37 
 
 		 235 aa  208  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  46.15 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  43.83 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  43.83 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  46.19 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  45.49 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  46.67 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  45.99 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  48.72 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  46.58 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  46.35 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  44.68 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  45.73 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  45.73 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  45.73 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  45.73 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  44.21 
 
 		 242 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  45.92 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  45.92 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  46.19 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  47.03 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  44.4 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  45.73 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  45.61 
 
 		 243 aa  204  9e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  42.44 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  43.88 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  44.26 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  46.12 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  47.66 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  43.4 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  41.6 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  44.02 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  45.3 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  45.49 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  45.49 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  42.98 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  45 
 
 		 238 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  48.75 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  44.73 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  44.26 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0807  UMP kinase  45.99 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  43.39 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  45.3 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  41.7 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  46.15 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  43.75 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  46.81 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  44.21 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  42.19 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  44.26 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>