More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3619 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3619  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  187  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1115  histone family protein DNA-binding protein  96.81 
 
 		 94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.545347  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0628  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0187  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1589  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3213  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 193 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 232 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  52.81 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2005  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 188 aa  98.6  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2805  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.535515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2337  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 185 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  52.33 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4997  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 185 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1360  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1151  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 209 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0440  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  47.31 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1260  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 237 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00209562  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  46.67 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10750  nucleoid DNA-binding protein  51.11 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0258  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  49.44 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  50.56 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  43.96 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  45.56 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4973  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 167 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00898585  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  46.67 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>