48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2819 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  85.71 
 
 		 229 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  44.95 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  45.92 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  46.67 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  45.81 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  44.16 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  45.32 
 
 		 222 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  42.64 
 
 		 304 aa  161  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  43.15 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  43.15 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  43.15 
 
 		 273 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  43.52 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  40.58 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  37.95 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 		 449 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  38.07 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  37.98 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  37.05 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.39 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.72 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  38.31 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  38.19 
 
 		 532 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  37.98 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  37.56 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  36.63 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.18 
 
 		 453 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  37.81 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  40.98 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  36.22 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  33.04 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  34.29 
 
 		 327 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  36.32 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  31.86 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  33 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  31.02 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  26.19 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  25.77 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  26.35 
 
 		 428 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  25.76 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 426 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  26.83 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  25.6 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  24.05 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  28.06 
 
 		 349 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>