129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0752 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  72.31 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  50.77 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  56.36 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  60 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  58.93 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  60.38 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  44.78 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  46.03 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  46.03 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  53.45 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  45 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  57.14 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  52.73 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  54.39 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  57.41 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  48.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  54.1 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  50.85 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  51.79 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.12 
 
 		 430 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  45.45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  54.55 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  47.62 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  46.43 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  46.55 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  56.6 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  58.49 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  46.55 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  51.79 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  56.6 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  48.28 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  50.91 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  43.94 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  50.91 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  54.72 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  54.72 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  49.12 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  52.83 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  44.64 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  49.12 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  54.72 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  48.33 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  46.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  52.83 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  48.33 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  41.38 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  54.55 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  46.55 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  46.55 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  51.72 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  53.45 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  51.72 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  46.55 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  51.72 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  40.98 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  40.98 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  40.98 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0056  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.825759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  45.61 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  56.6 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  45.28 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  56.6 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  39.06 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  46.3 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>