243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0503 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  68.52 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  64.15 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  61.82 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  64.15 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  57.41 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  60 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  52.73 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  56.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  52.73 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  51.85 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  50.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  53.7 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  57.41 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  52.73 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  54.72 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  48.15 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  49.09 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  53.7 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  50 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  51.85 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  50 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  54.72 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  51.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  48.15 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  51.85 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  48.15 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  53.7 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  51.85 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  48.98 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  51.85 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  48.98 
 
 		 269 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  48.94 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  48.94 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 298 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  46.3 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  47.92 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  45.61 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 252 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 302 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 341 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 245 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  48 
 
 		 271 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  52.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  52.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>