139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0029 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  95.31 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 82 bp  95.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  93.22 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  91.38 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t015  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t010  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000827659  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0111  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000389505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.193422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.672114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0903  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0031  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0037  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519454  normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0038  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000710628  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0036  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000195889  normal  0.0261952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0107  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0100  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000931181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0115  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>