60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2954 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  100 
 
 		 308 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  46.18 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  36.27 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  31.39 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  31.86 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  32.78 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  30.52 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  26.22 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  27.65 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.38 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  28.48 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.34 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.29 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  25.26 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  30.63 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  30.28 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  32.95 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  27.68 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  26.86 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  31.39 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  31.9 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  29.65 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  26.4 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  30.41 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.28 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.69 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  27.23 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  24.6 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  24.12 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.46 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  26.75 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.09 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.16 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.49 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.18 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  23.5 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  28.99 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.03 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.55 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.03 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.04 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  25.97 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  24.46 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  29.14 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.97 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.04 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.55 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.1 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.86 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  23.84 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  25.27 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  25.91 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.94 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  24.48 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  26.7 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.02 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.22 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.75 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  29.9 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>