More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0411 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.52 
 
 
327 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.82 
 
 
249 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.97 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.66 
 
 
387 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  37.7 
 
 
323 aa  161  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  36.51 
 
 
248 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.33 
 
 
250 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.55 
 
 
245 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.71 
 
 
237 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  35.42 
 
 
289 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  35.42 
 
 
289 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  38.33 
 
 
242 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.84 
 
 
264 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.51 
 
 
255 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.16 
 
 
247 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  34.54 
 
 
248 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.82 
 
 
246 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  33.87 
 
 
256 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  35.27 
 
 
248 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  36.93 
 
 
242 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  37.24 
 
 
251 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.29 
 
 
246 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.17 
 
 
246 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  34.57 
 
 
251 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.98 
 
 
246 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  34.14 
 
 
248 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.66 
 
 
310 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.71 
 
 
246 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.13 
 
 
246 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.71 
 
 
246 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  37.4 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.83 
 
 
246 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.13 
 
 
246 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  34.66 
 
 
248 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.71 
 
 
246 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.18 
 
 
247 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  33.88 
 
 
250 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.6 
 
 
251 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  35.83 
 
 
247 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.93 
 
 
250 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.39 
 
 
245 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
245 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.29 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.16 
 
 
246 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.03 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  34.3 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  35.42 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.18 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.02 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.97 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.97 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.97 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.47 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
246 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.02 
 
 
250 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.77 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0685  rRNA methyltranferase  36.25 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002269  23S rRNA (guanosine-2'-O-) -methyltransferase RlmB  35.44 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
258 aa  144  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  35.77 
 
 
247 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.2 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.03 
 
 
245 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  35.2 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
246 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.02 
 
 
247 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  35.2 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.02 
 
 
246 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  35.5 
 
 
330 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  34.29 
 
 
246 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  35.42 
 
 
247 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  34.44 
 
 
249 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.68 
 
 
247 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  33.89 
 
 
248 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  36.32 
 
 
233 aa  141  9e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  33.89 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.02 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  34.02 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.88 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.65 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.26 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.65 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  34.04 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.65 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  33.06 
 
 
249 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
247 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>