More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0676 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0676  putrescine carbamoyltransferase  100 
 
 
346 aa  720    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208012  normal  0.0438433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2191  putrescine carbamoyltransferase  97.98 
 
 
347 aa  706    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12530  putrescine carbamoyltransferase  76.42 
 
 
351 aa  561  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.797625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0670  putrescine carbamoyltransferase  61.96 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000365109  hitchhiker  0.0000131394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3447  ornithine carbamoyltransferase  59.88 
 
 
338 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2960  putrescine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
349 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0654  putrescine carbamoyltransferase  44.51 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.889245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1142  putrescine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  43.4 
 
 
313 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  42.14 
 
 
302 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  40.19 
 
 
314 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  40.57 
 
 
315 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  41.74 
 
 
302 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
313 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  39.5 
 
 
308 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  40.25 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  42.17 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  39.94 
 
 
301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  40.32 
 
 
313 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  40.06 
 
 
304 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  39.75 
 
 
323 aa  219  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  38.05 
 
 
309 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  38.58 
 
 
309 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  37.65 
 
 
305 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  40 
 
 
313 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  41.19 
 
 
306 aa  216  7e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  39.06 
 
 
300 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  38.94 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  41.9 
 
 
307 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  40.28 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  38.63 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  38.84 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  38.53 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  38.15 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  37.99 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  41.05 
 
 
299 aa  212  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 
309 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  39.81 
 
 
312 aa  212  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  37.54 
 
 
313 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  37.69 
 
 
316 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
306 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 
305 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  37.61 
 
 
316 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  37.69 
 
 
316 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
306 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  39.43 
 
 
309 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
306 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  37.76 
 
 
304 aa  209  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  37.69 
 
 
316 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4137  ornithine carbamoyltransferase  37.78 
 
 
322 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  39.12 
 
 
312 aa  209  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0795  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 
306 aa  208  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  38.24 
 
 
306 aa  208  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  40.13 
 
 
312 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  40.75 
 
 
355 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1074  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 
306 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  38.01 
 
 
311 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  38.01 
 
 
307 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  38.01 
 
 
311 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  37 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  38.17 
 
 
296 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1012  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 
306 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0827825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  40.31 
 
 
332 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  36.88 
 
 
306 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  35.89 
 
 
309 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  38.12 
 
 
304 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  37.81 
 
 
297 aa  205  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  36.22 
 
 
304 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  41.27 
 
 
312 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  39.13 
 
 
329 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  38.36 
 
 
303 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  38.68 
 
 
305 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  38.08 
 
 
302 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  39.64 
 
 
311 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  37.89 
 
 
306 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
305 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  38.01 
 
 
312 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  36.76 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  37.11 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  38.75 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  35.19 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  36.19 
 
 
312 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  38.24 
 
 
300 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  36.56 
 
 
305 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  35.26 
 
 
312 aa  199  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  34.89 
 
 
323 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  36.16 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3190  ornithine carbamoyltransferase  35.96 
 
 
312 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1594  ornithine carbamoyltransferase  36.65 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  37.22 
 
 
305 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2058  ornithine carbamoyltransferase  37.97 
 
 
307 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.638653  normal  0.14695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  37.42 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  37.5 
 
 
308 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  36.88 
 
 
304 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>