More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1646 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
313 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  95.21 
 
 
313 aa  622  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  75.08 
 
 
332 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  73.08 
 
 
312 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 
313 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  57.01 
 
 
317 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 
312 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  53.19 
 
 
331 aa  361  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  53.64 
 
 
331 aa  360  2e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  53.94 
 
 
330 aa  358  8e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  55.66 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.03 
 
 
331 aa  348  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  53.03 
 
 
331 aa  348  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  52.57 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
327 aa  333  2e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02370  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
331 aa  332  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00840  ornithine carbamoyltransferase  50.76 
 
 
331 aa  332  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.96498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 
337 aa  332  6e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  51.23 
 
 
335 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  50.92 
 
 
332 aa  329  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  50.92 
 
 
332 aa  328  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  50.92 
 
 
332 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  50.92 
 
 
332 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  48.19 
 
 
334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  49.08 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  49.08 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  50.92 
 
 
332 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
334 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4897  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
332 aa  322  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06550  ornithine carbamoyltransferase  48.94 
 
 
331 aa  318  5e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  0.675152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  46.85 
 
 
334 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1948  ornithine carbamoyltransferase  49.24 
 
 
331 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0387191  normal  0.307808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
332 aa  316  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  46.85 
 
 
334 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0031  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 
334 aa  316  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  47.29 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  49.37 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  46.99 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  46.99 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  46.99 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.76 
 
 
314 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
320 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  47.11 
 
 
333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
333 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
333 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2708  ornithine carbamoyltransferase  47.38 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  46.83 
 
 
335 aa  306  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
336 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
336 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
336 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  46.22 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  46.63 
 
 
335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  43.84 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0860  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
313 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  46.32 
 
 
335 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  46.32 
 
 
335 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  46.01 
 
 
335 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2321  ornithine carbamoyltransferase  46.04 
 
 
354 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  46.99 
 
 
332 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  43.84 
 
 
336 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  45.4 
 
 
335 aa  298  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  45.4 
 
 
339 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
334 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
334 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 
312 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  43.84 
 
 
336 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  46.39 
 
 
332 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
336 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1457  ornithine carbamoyltransferase  44.07 
 
 
338 aa  294  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 
334 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  44.14 
 
 
336 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  44.48 
 
 
334 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.48 
 
 
334 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.48 
 
 
334 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  44.48 
 
 
334 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.48 
 
 
334 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.48 
 
 
334 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.48 
 
 
337 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  43.84 
 
 
336 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.79 
 
 
339 aa  291  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  44.17 
 
 
334 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  43.87 
 
 
334 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.17 
 
 
334 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.17 
 
 
334 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  44.17 
 
 
334 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>