More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1594 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1594  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
308 aa  635    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1807  ornithine carbamoyltransferase  87.5 
 
 
305 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  hitchhiker  0.00296151 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2058  ornithine carbamoyltransferase  89.25 
 
 
307 aa  553  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.638653  normal  0.14695 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0825  ornithine carbamoyltransferase  82.57 
 
 
306 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
313 aa  364  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
313 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0407  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
323 aa  280  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 
312 aa  275  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
313 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 
312 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
309 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
309 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
309 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
332 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
306 aa  265  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 
307 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
313 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 
313 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
308 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
305 aa  258  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1858  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
307 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
315 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
308 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  44.08 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  42.16 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
310 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
309 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
317 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
312 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 
308 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
317 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
328 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 
316 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
312 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
340 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
316 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
355 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
312 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  41.97 
 
 
311 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
312 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 
313 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  42.11 
 
 
308 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
312 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 
312 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  42.3 
 
 
311 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 
312 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
316 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  44.63 
 
 
314 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
316 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 
316 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  41.69 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 
306 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2766  ornithine carbamoyltransferase  40.84 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.821483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  42.3 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 
312 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
304 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
306 aa  242  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 
323 aa  242  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
307 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
307 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  41.8 
 
 
331 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  44.91 
 
 
318 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  43.83 
 
 
307 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 
304 aa  242  7e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 
323 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 
307 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  42.39 
 
 
305 aa  241  9e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
308 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  43.28 
 
 
303 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  38.51 
 
 
307 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  41.78 
 
 
306 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
300 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>