More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2766 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2766  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
306 aa  634    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.821483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
307 aa  285  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
312 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
309 aa  278  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  45.81 
 
 
313 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.3 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  44.11 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
305 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
306 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
306 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
306 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
309 aa  265  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 
304 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 
305 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 
313 aa  262  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
318 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  41.61 
 
 
303 aa  261  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 
309 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
309 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
313 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 
310 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
311 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
308 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  42.53 
 
 
308 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 
311 aa  259  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
318 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
302 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 
309 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 
301 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 
309 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
332 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 
303 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 
315 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
301 aa  255  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
306 aa  254  9e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  42.62 
 
 
313 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
312 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
316 aa  252  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 
312 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
317 aa  251  9.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  41.08 
 
 
303 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  40.92 
 
 
306 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  41.61 
 
 
303 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
316 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
323 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 
312 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
338 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 
303 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  42.38 
 
 
312 aa  249  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
312 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
309 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46.44 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.07 
 
 
316 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
316 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.43 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  41.2 
 
 
303 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.43 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  42.19 
 
 
302 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
316 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.73 
 
 
316 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 
308 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  43.43 
 
 
316 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 
308 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 
320 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  42.14 
 
 
313 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  40.98 
 
 
321 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  42.57 
 
 
312 aa  245  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  40.86 
 
 
312 aa  245  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
309 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 
330 aa  244  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 
323 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  41.39 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  41.45 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1142  putrescine carbamoyltransferase  41.56 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  41.5 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  40.45 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
308 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1807  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 
305 aa  243  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  hitchhiker  0.00296151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  40.07 
 
 
309 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2960  putrescine carbamoyltransferase  41.37 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  43.05 
 
 
309 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  40.26 
 
 
305 aa  242  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>