32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1027 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1027  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 392 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  24.26 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  24.39 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  23.7 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  19.35 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  19.35 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  19.35 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  19.35 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  19.35 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  19.35 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  19.35 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  19.35 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.26 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>