68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2743 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  713    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  98.89 
 
 		 359 aa  704    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  59.2 
 
 		 360 aa  346  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  38.25 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  37.95 
 
 		 323 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  33.61 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  33.91 
 
 		 567 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  37.37 
 
 		 541 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  33.62 
 
 		 567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  34.86 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  41.87 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  38.71 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  35.29 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  40.41 
 
 		 551 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  40.24 
 
 		 232 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  48.36 
 
 		 125 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  43.02 
 
 		 178 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 896 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 858 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 930 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  45.61 
 
 		 58 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 872 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  23.25 
 
 		 771 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  31.79 
 
 		 241 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  28.95 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 		 1057 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  27.55 
 
 		 783 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  23.31 
 
 		 741 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  26.01 
 
 		 714 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  30.2 
 
 		 755 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  26.51 
 
 		 741 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  22.78 
 
 		 741 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  25.64 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  26.69 
 
 		 741 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  28.76 
 
 		 767 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  26.69 
 
 		 741 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  28.63 
 
 		 767 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  33.67 
 
 		 792 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  23.68 
 
 		 756 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  22.98 
 
 		 692 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 774 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 		 731 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  22.55 
 
 		 692 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 713 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 731 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  36 
 
 		 661 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  36 
 
 		 661 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  24.1 
 
 		 754 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  31.31 
 
 		 697 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 713 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 713 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  34.48 
 
 		 757 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 777 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  26.03 
 
 		 794 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>