More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2256 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 554 aa  1104    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  59.71 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  59.31 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  57.17 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  50.63 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  48.84 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  49.73 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  49.19 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  47.55 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.93 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  46.39 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  49.55 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  48.73 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  46.13 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  46.5 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  45.59 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.01 
 
 		 520 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  45.59 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  47.81 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  45.23 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  46.31 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  43.57 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  46.63 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  44.7 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.02 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  46.85 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.55 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  43.83 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  50.45 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  46.01 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  43.75 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  44.42 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  44.42 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  44.19 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  47.18 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  48.47 
 
 		 505 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  48.45 
 
 		 499 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  43.86 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  44.97 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  43.45 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  45.14 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  49.37 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  44.4 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  45.55 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  46.06 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2728  magnesium chelatase ChlI subunit  70.46 
 
 		 324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  44.78 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  43.22 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  42.81 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  44.6 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  45.77 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.53 
 
 		 506 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  46.7 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  41.94 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  47.81 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  45.2 
 
 		 518 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  41.8 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.36 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  41.94 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  44.74 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.68 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  45.93 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  47.02 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2773  competence protein ComM, putative  71.48 
 
 		 291 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  43.4 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  43.57 
 
 		 530 aa  422  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  38.76 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  44.93 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  39.49 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  40.69 
 
 		 506 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  44.57 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  46.51 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 510 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  41.62 
 
 		 508 aa  412  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  47.63 
 
 		 504 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.06 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  44.46 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  40.57 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  46.22 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  40.29 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  46.37 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  44.16 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  44.38 
 
 		 506 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  44.04 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  46.18 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  44.57 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  46.31 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  45.97 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  43.56 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  46.53 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  37.41 
 
 		 499 aa  392  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  38.3 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  43.79 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  45.24 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  43.62 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  52.72 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  39.71 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  36.98 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>