More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2146 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
115 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  91.3 
 
 
115 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  80 
 
 
115 aa  194  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  78.38 
 
 
115 aa  189  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  72.17 
 
 
115 aa  174  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  69.91 
 
 
118 aa  173  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
115 aa  150  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
115 aa  150  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
115 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  59.65 
 
 
117 aa  144  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 
115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
118 aa  140  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  59.82 
 
 
116 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  60.18 
 
 
114 aa  140  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  59.82 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
118 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  60.91 
 
 
116 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
118 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 
118 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
119 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
118 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
128 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
116 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
119 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  56.36 
 
 
117 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
119 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  63 
 
 
116 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  58.49 
 
 
120 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  56.25 
 
 
115 aa  133  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60.19 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  58.65 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  59.62 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
119 aa  130  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
120 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  57.27 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
116 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1945  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 
134 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.33 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  53.7 
 
 
148 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
113 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
114 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  54.78 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  55.05 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  64.21 
 
 
136 aa  127  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  59.43 
 
 
117 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  63.16 
 
 
136 aa  126  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  56.25 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  53.57 
 
 
116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  53.64 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 
114 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 
115 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 
127 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 
113 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  56.25 
 
 
124 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 
147 aa  124  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>