18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0751 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  855    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  55.56 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  53.49 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  43.82 
 
 
514 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  41.46 
 
 
229 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  43.82 
 
 
520 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  43.82 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  49.32 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  41.27 
 
 
320 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  37.68 
 
 
364 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  36.49 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  36.92 
 
 
262 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  41.67 
 
 
290 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  35.71 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  34.85 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  39.13 
 
 
267 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>