More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0675 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  61.96 
 
 		 545 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  65.1 
 
 		 944 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 538 aa  1093    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  67.11 
 
 		 520 aa  695    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  67.17 
 
 		 522 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  67.55 
 
 		 525 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  64.46 
 
 		 540 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  67.17 
 
 		 521 aa  700    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  98.7 
 
 		 538 aa  1078    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  77.44 
 
 		 532 aa  824    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  60.93 
 
 		 545 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  63.21 
 
 		 520 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 548 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 547 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  48.9 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  48.34 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  47.71 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  46.69 
 
 		 559 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 562 aa  478  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  45.1 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  45.13 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.01 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  50.66 
 
 		 541 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  43.83 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  48.38 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 		 615 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  48.26 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 546 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  49.56 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  49.52 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  45.36 
 
 		 550 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 649 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 543 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 543 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 549 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  44.12 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  45.75 
 
 		 552 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  49.16 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  47.73 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  49.73 
 
 		 550 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 556 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 556 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  45.67 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  45.07 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  45.7 
 
 		 554 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  45.66 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  43.67 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  42.31 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  47.96 
 
 		 550 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  48.36 
 
 		 556 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  48.91 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  45.66 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 540 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  47.05 
 
 		 545 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  45.47 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  46.68 
 
 		 541 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  42.39 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  44.52 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 		 549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  47.63 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>