45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3923 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 
362 aa  741    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0173  dehydrogenase (flavoproteins)  45.2 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0169  dehydrogenase (flavoproteins)  35.43 
 
 
360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  36.24 
 
 
356 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0218  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  36.09 
 
 
366 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2557  dehydrogenase (flavoproteins)  36.69 
 
 
371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  35.63 
 
 
355 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1245  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.09 
 
 
355 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  26.96 
 
 
372 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0688  FAD dependent dehydrogenase  26.76 
 
 
364 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3408  hypothetical protein  29.37 
 
 
260 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
369 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
369 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  51.28 
 
 
480 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  23 
 
 
559 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  23 
 
 
544 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  25.88 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  40.32 
 
 
469 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3442  putative oxidoreductase  44.9 
 
 
481 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
455 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  44.68 
 
 
473 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  47.5 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  27.92 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1543  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42 
 
 
618 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.55 
 
 
506 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  47.5 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.7 
 
 
348 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  42.11 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0542  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
455 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  41.18 
 
 
470 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  40.43 
 
 
490 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.3 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.3 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  42.55 
 
 
471 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.3 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.3 
 
 
653 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  47.22 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
453 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.53 
 
 
492 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  35.82 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  38.33 
 
 
612 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>