33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0061 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 421 aa  859    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  51.31 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  42.72 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  42.48 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 		 440 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  43.33 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  41.45 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  39.47 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  39.47 
 
 		 511 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.05 
 
 		 426 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  26.88 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.84 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.63 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 265 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.07 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>