More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1464 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  347  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  46.38 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  39.47 
 
 
195 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  34.78 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  34.97 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  34.97 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  32.35 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  33.79 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  32.41 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
286 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
186 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  37.62 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  31.97 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2111  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0586754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  35.17 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  25 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  34.48 
 
 
195 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  31.29 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.29 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  31.29 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  31.29 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.19 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  29.31 
 
 
211 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
207 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  30.19 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4280  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  32.41 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1731  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.75 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  29.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  28.86 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
196 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  32.67 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
203 aa  54.3  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
196 aa  54.3  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1904  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607979  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  31.33 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  30.61 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.42 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  27.78 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>