More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1191 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  69.94 
 
 		 488 aa  672    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 488 aa  967    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  65.16 
 
 		 489 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  66.67 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  64.75 
 
 		 489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  64.96 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  59.29 
 
 		 533 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  54.16 
 
 		 497 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  52.68 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  50.1 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  53.78 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  53.74 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  57.98 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  57.95 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  57.45 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 		 496 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  58.31 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  57.18 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  52.3 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 		 542 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  52.33 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  52.08 
 
 		 500 aa  415  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  56.53 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  55.97 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  48.54 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  51.55 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  51.43 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  49.46 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  51.1 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  57.58 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  50.56 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  53.35 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 500 aa  369  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  54.42 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  51.32 
 
 		 500 aa  362  9e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  42.91 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  42.98 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.08 
 
 		 511 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 		 508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  46.67 
 
 		 493 aa  312  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.05 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  47.01 
 
 		 491 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  41.63 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  41.82 
 
 		 510 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  41.82 
 
 		 510 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.37 
 
 		 503 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  44.58 
 
 		 496 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  41.59 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  40.9 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 		 511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 		 511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.12 
 
 		 518 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 		 503 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  46.28 
 
 		 496 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  49.85 
 
 		 496 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  45.97 
 
 		 496 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  47.59 
 
 		 556 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.54 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  40.65 
 
 		 511 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.08 
 
 		 496 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  46.69 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 		 503 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 		 515 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  46.4 
 
 		 518 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  47.22 
 
 		 497 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.58 
 
 		 503 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.58 
 
 		 503 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  41.36 
 
 		 511 aa  296  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  46.48 
 
 		 512 aa  296  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  40.97 
 
 		 502 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  46.39 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  41.7 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  41.9 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  46.11 
 
 		 497 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  45.11 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  46.51 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  46.8 
 
 		 536 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  46.13 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>