More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0860 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  100 
 
 
162 aa  337  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.83 
 
 
157 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  33.55 
 
 
159 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  31.3 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  31.33 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  35 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  32.06 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  31.71 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  30 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.25 
 
 
183 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 
155 aa  87.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  39.5 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  31.06 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  33.33 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  30.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  37.86 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  37.23 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  34.81 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  34.81 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  32.69 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  35.11 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  27.89 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  38.3 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  33.59 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  33.88 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  32.81 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  32.69 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  34.35 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  36.45 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.15 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.81 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  32.59 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.89 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.25 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  27.54 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  31.58 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  34.31 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.21 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  34.71 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  35.35 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.74 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.45 
 
 
194 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.43 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  27.36 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.82 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.79 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  27.27 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.1 
 
 
409 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  26.71 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.91 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.93 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.68 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  34.02 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  29.53 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  37.04 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.64 
 
 
455 aa  70.5  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  33.03 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  27.39 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.15 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  34.45 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  26.83 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  33.63 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  27.68 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  35.11 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  29.93 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  30.46 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.2 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  34.71 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  43.08 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.17 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  34.02 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.63 
 
 
376 aa  67.4  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  35.56 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.93 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>