46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0386 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  903    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3796  hypothetical protein  46.65 
 
 
517 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0524079  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2157  hypothetical protein  43.13 
 
 
517 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0332919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3444  hypothetical protein  32.78 
 
 
403 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  42.11 
 
 
379 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  51.92 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.71 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  59.09 
 
 
307 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  50 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  40.98 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  46.3 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  40.32 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  37.5 
 
 
331 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  34.07 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  42.37 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  33.73 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  45.83 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  39.62 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  37.29 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  38.71 
 
 
398 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  38.98 
 
 
382 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  35.44 
 
 
320 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  33.04 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  30.08 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  40 
 
 
375 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  37.5 
 
 
261 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  32.14 
 
 
377 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  37.84 
 
 
301 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  34.78 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  34.78 
 
 
319 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  34.43 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  31.51 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 
618 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  41.07 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  42.5 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  44.9 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  35.29 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  30.49 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  42.37 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  42.37 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  40 
 
 
505 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  41.07 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.85 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  40 
 
 
398 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  34.85 
 
 
442 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>