31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1513 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  303  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2361  putative signal transduction protein with CBS domains  45.16 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1813  CBS domain-containing protein  44.16 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1607  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1015  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.110354  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1509  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1999  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0963  putative signal transduction protein with CBS domains  31.85 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158107  normal  0.526521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0965  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000272777  normal  0.399502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  26.97 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2034  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0795  CBS domain-containing protein  25.15 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0152604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 301 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  25.79 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 603 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2123  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00617964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 		 256 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  27.1 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  34.29 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2435  CBS domain containing membrane protein  27.52 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2721  putative signal transduction protein with CBS domains  26.89 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.02 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0325  hypothetical protein  27.01 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1495  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.42 
 
 		 873 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  31.33 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 		 885 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>