More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1460 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0095  NAD+ synthetase  52.92 
 
 
630 aa  716    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0107801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1460  NAD+ synthetase  100 
 
 
635 aa  1315    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  32.91 
 
 
543 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  32.39 
 
 
558 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  29.67 
 
 
546 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  31.51 
 
 
571 aa  231  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  30 
 
 
552 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  33.01 
 
 
543 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  30.99 
 
 
566 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  30.92 
 
 
583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  29.28 
 
 
566 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.97 
 
 
556 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.46 
 
 
566 aa  220  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  30.52 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  31.56 
 
 
552 aa  217  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.83 
 
 
577 aa  217  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  27.55 
 
 
575 aa  216  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
554 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  32.54 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  30.66 
 
 
540 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  28.23 
 
 
565 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  30.46 
 
 
567 aa  211  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  27.92 
 
 
565 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  28.79 
 
 
574 aa  209  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  29.02 
 
 
573 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  29.21 
 
 
573 aa  207  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  28.81 
 
 
587 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  29.55 
 
 
539 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.88 
 
 
576 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  29.43 
 
 
556 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  29.03 
 
 
561 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  30.03 
 
 
576 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  28.39 
 
 
565 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  29.76 
 
 
561 aa  203  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  28.87 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  30.46 
 
 
567 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  29.32 
 
 
540 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  30.16 
 
 
545 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  29.32 
 
 
540 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  29.15 
 
 
540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.27 
 
 
567 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  32.83 
 
 
558 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  28.64 
 
 
567 aa  200  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  31.08 
 
 
559 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  29.25 
 
 
540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  29.89 
 
 
566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  30.02 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  27.76 
 
 
565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  28.46 
 
 
554 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.53 
 
 
571 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  28.3 
 
 
584 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  29.21 
 
 
545 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  28.89 
 
 
560 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  28.64 
 
 
544 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0975  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.65 
 
 
566 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212633  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  28.64 
 
 
554 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  28.39 
 
 
565 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  30.1 
 
 
560 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  31.25 
 
 
548 aa  193  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  30.36 
 
 
559 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.37 
 
 
543 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  32.66 
 
 
570 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  28.29 
 
 
547 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3718  NAD+ synthetase  30.52 
 
 
566 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0770195  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5607  NAD+ synthetase  30.86 
 
 
566 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.1 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  27.83 
 
 
538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  28.85 
 
 
545 aa  191  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  29.47 
 
 
550 aa  191  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  29.47 
 
 
550 aa  191  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.27 
 
 
540 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.73 
 
 
598 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  29.9 
 
 
557 aa  189  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  30.2 
 
 
559 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  28.21 
 
 
560 aa  189  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  29.49 
 
 
574 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  28.34 
 
 
561 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  28.27 
 
 
536 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.46 
 
 
542 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  28.18 
 
 
562 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  27.8 
 
 
582 aa  187  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  28.09 
 
 
561 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  28.09 
 
 
561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  28.46 
 
 
545 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.42 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.3 
 
 
542 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  27.82 
 
 
571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  28.38 
 
 
536 aa  183  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  27.78 
 
 
569 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  27.62 
 
 
569 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  28.69 
 
 
569 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  28.1 
 
 
564 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.26 
 
 
546 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  29.6 
 
 
591 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  30.02 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.97 
 
 
597 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  29.31 
 
 
586 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  29.94 
 
 
541 aa  180  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  28.73 
 
 
559 aa  180  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.81 
 
 
599 aa  180  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>