31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0868 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  41.97 
 
 		 890 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0868  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 864 aa  1791    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  39.1 
 
 		 898 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  35.91 
 
 		 858 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  33.82 
 
 		 877 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  41.77 
 
 		 899 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  36.23 
 
 		 892 aa  260  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  33.48 
 
 		 902 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 835 aa  224  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  31.11 
 
 		 881 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 885 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 840 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  24.9 
 
 		 930 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5300  type III restriction enzyme, res subunit family  24.35 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  22.27 
 
 		 896 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  21.94 
 
 		 893 aa  54.7  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  22.98 
 
 		 923 aa  54.7  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  23.84 
 
 		 911 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  21.2 
 
 		 912 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4002  hypothetical protein  21.84 
 
 		 767 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  24.57 
 
 		 882 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1462  superfamily II DNA/RNA helicase  21.33 
 
 		 736 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  36.54 
 
 		 982 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  23.14 
 
 		 911 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1418  type III restriction protein res subunit  25.82 
 
 		 751 aa  48.5  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  36.36 
 
 		 998 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0884  hypothetical protein  21.15 
 
 		 840 aa  45.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4078  type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 913 aa  45.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.778545  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4044  type III restriction protein res subunit  23.31 
 
 		 867 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.856779 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4239  type III restriction enzyme, res subunit  27.56 
 
 		 907 aa  44.3  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>